by species
Frequently observed ectomycorrhizal fungal species in Japan
| division | family | genus | species_id | species |
| Ascomycota | Elaphomycetaceae | Elaphomyces | ||
| Tuberaceae | Tuber | |||
| Basidiomycota | Amanitaceae | Amanita | ||
| Cortinariaceae | Cortinarius | Cortinarius scaurus | ||
| Cortinarius tortuosus | ||||
| Cortinarius hemitrichus | ||||
| Cortinarius barlowensis | ||||
| Cortinarius anomalus | ||||
| Cortinarius acutovelatus | ||||
| Inocybaceae | Inocybe | |||
| Inocybe napipes | ||||
| Entolomataceae | Entoloma | |||
| Strophariaceae | Hebeloma | Hebeloma incarnatulum | ||
| Hydnangiaceae | Laccaria | Laccaria cf. laccata | ||
| Laccaria laccata | ||||
| Laccaria cf. laccata | ||||
| Atheliaceae | Atheliaceae | |||
| Piloderma | ||||
| Piloderma fallax | ||||
| Piloderma olivaceum | ||||
| Tylospora | Tylospora fibrillosa | |||
| Boletaceae | Xerocomus | |||
| Ceratobasidiaceae | - | |||
| Clavulinaceae | - | Clavulina castaneipes | ||
| Russulaceae | Lactarius | Lactarius chrysorrheu | ||
| Lactarius imperceptus | ||||
| Lactarius hatsudake | ||||
| Lactarius tabidus | ||||
| Russula | Russula crassotunicata | |||
| Russula turci | ||||
| Russula granulata | ||||
| Russula densifolia | ||||
| Russula ochroleuca | ||||
| Russula abietina | ||||
| R. aquosa / R. bicolor | ||||
| Russula peckii | ||||
| Russula bicolor | ||||
| Sebacinaceae | Sebacina | |||
| Thelephoraceae | Tomentella / Thelephora | Tomentella sublilacina | ||
| Tomentella stuposa | ||||
| Tomentella terrestris | ||||